La Marine Nationale est chargée de :

• - Surveiller et défendre les frontières maritimes et fluviales du Bénin
• - Protéger et sécuriser les eaux maritimes du Bénin
• -Protéger et sécuriser les eaux maritimes du Bénin
• - Sauvegarder les intérêts de l'Etat béninois en mer par la participation à la mise en oeuvre de l'action de l'Etat en mer
• - Ecécuter toutes autres missions à elle confiées par le Chef d'Etat-major Général.

L'Etat-major de la Marine nationale est placé sous l'autorité d'un officier général ou d'un officier supérieur titulaire du brevet de l'enseignement militaire supérieur du second degré. Il prend le titre de Chef D'Etat-major de la Marine nationale.